在分析氣象色譜儀的時候，
毛細管柱應該是使用較為廣泛的。它又稱空心柱，其分離效率比填充柱高，可解決復雜的填充柱難于解決的分析問題。在在食品安全、環境保護、石油化工、電子電氣等方面都有廣泛應用。
毛細管柱的種類
一般分為四種類型：壁涂開管柱(WCOT)、載體涂漬開管柱(SCOT)、交聯毛細管柱(CLOT)和多孔層開管柱(PLOT)。經典的毛細管柱為壁涂開管柱管內經預處理后將固定液直接涂漬在內壁上。因其制備難、柱子的重復性差、內表面小、涂漬量小和相比β值大，將導致有效塔板數和實際分離能力不高，且熱穩定性也較差，已很少使用。
毛細管柱的長短直接影響到保留時間和分離效率。實驗室應用的多為5m、7.5m、10m、12.5m、15m、25m、30m、50m、60m、75m、100m和105m等。較常見的長度是30m。
對于快速分析來說，除了選擇適當的內徑，柱長度也短許多(例如5～15mx0.25mm)。只有這樣，才有可能在最短的時間內，得到理想的分離效果和分析結果。
如果方法需要改進提高分辨率，較長的如60m或100m，是理想的選擇。分辨率與柱長的平方根成正比。需要注意的是，像一根60m長的色譜柱相對于30m的柱子，其分辨率提高近40%，但分析時間會成倍增長。
在揮發物的分析應用中，為了改善分離效果，常使用較長的柱型，如50m、60m和100m等。在氣態樣品和精細烴分析應用中，較長色譜柱的使用較為普遍。
